Siswa Mts Nurul Muhajirin banyak meraih berbagai prestasi baik akademik, maupun non-akademik. Diantara prestasi tersebut yang sempat terdata, kami rangkum dalam tabel prestasi siswa berikut ini :
Prestasi sekolah (Akademik dan non akademik ) yang pernah diraih.
| Tahun | Nama Siswa | Juara | Tingkat | Jenis Lomba | Penghargaan |
| 2004 | Hendrik Setiawan | 6 | Kabupaten | Hifdzul Qur’an | Piagam, Uang |
| Lilik Nur Indah sari | 2 | Kecamatan | Syarhil Qur’an | Piala, Piagam, Uang | |
| Sriyanto | 4 | Kecamatan | Hifdzul Qur,an Jus 30 | Piagam, Uang | |
| Rukiyati Wulan S | 1 | Kecamatan | Qori’ah | Piala, Piagam, Uang | |
| Rukuyati wulan S | 3 | Kabupaten | Qori’ah | Piala, Piagam, Uang | |
| 2005 | Samsul Hakim | 1 | Propinsi | Sepak Takraw | Medali Emas |
| Samsul Hakim | – | Nasional | Sepak Takraw | – | |
| Lilik Nur Indah Sari | 2 | Kecamatan | Kaligrafi Mushaf | Piala, Piagam, Uang | |
| Rukiyati Wulan S | 3 | Kecamatan | Hifdzul Qur’an Jus 30 | Piala, piagam, Uang | |
| Rukiyati Wulan S | 4 | kabupaten | Hifdzul Qur’an Jus 30 | Piala, Piagam, Uang | |
| Zakiyatul Fakhirah | 3 | Kecamatan | Fahmil Qur’an | Piala, Piagam, Uang | |
| 2006 | Hendrik Setiawan | 3 | Propinsi | Pidato B. Indonesia | Piala |
| Lilik Nur Indah Sari | 3 | Kecamatan | Kaligrafi Mushaf | Pala, Piagam, uang | |
| Rukiyati Wulan S | 2 | Kabupaten | Hifdzul Qur’an | Pila, Piagam, Uang | |
| 2007 | Rahmat Efendy | 6 | Kabupaten | Syarhil Qur’an | Piagam, Uang |
| Rahmat Efendy | 1 | Kabupaten | Sepak Takraw | Piala, Piagam, Uang | |
| Rukiyati Wulan S | 4 | kabupaten | Hifdzul Qur’an | Piala, Piagam, Uang | |
| Zakiyatul Fakhirah | 4 | Kabupaten | Fahmil Qur’an | Piagam, Uang | |
| Maulidin | 4 | Kabupaten | Kaligrafi Mushaf | Piagam, Uang | |
| 2009 | Tim Futsal | 3 | Kabupaten | Futsal | Piagam, Uang |
| Tim Volly Putra | 3 | Kabupaten | Volly Putra | Piagam, Uang | |
| Tim Volly Putri | 3 | Kabupaten | Volly Putri | Piagam, Uang | |
| Tim Takraw | 2 | Kabupaten | Takraw | Piagam, Uang | |
| 2009 | Saiful Rahmat | 1 | Kabupaten | Lari 100 M | Piagam, Uang |
| Siti Kurnia, Lina Aditama, Istiqomah | 2 | Kabupaten | Syarhil Qur’an | Piagam, Uang | |
| Novi Kumala Sari | 2 | Kabupaten | Lari 100 M | Piagam, Uang | |
| Novi Kumala sari | 3 | Kabupaten | Lompat Jauh | Piagam, Uang | |
| Rochmah Aunilah, Ima Suciati, Tari Puji Astuti | 2 | Kabupaten | Fahmil Qur’an | Piagam, Uang | |
| Fathul Manan | 2 | Kabupaten | Tilawah | Piagam, Uang | |
| Raodatul Jannah | 2 | Kabupaten | Tilawah | Piagam, Uang | |
| Hendri Saputra | 2 | Kabupaten | Tenis Meja | Piagam, Uang | |
| Wahyuni | 3 | Kabupaten | Tenis Meja | Piagam, Uang | |
| Kholifah Alim | 3 | Kabupaten | Bulu Tangkis | Piagam, Uang | |
| Zainal Arifin | 3 | Kabupaten | Pidato Bahasa Arab | Piagam, Uang | |
| Amnil Izza | 2 | Kabupaten | Pidato Bahasa Inggris | Piagam, Uang |